腸道黏膜免疫學屏障是防御腸道病原體和內毒素入侵的重要防線，slgA在腸道黏膜免疫中發揮重要作用。sIgA是保護腸黏膜的一個重要成分，既能阻止腸腔內細菌在黏膜表面定植，也能中和內毒素。有研究發現，在腸黏膜遭受O157大腸桿菌感染時，抗內毒素核心多糖的特異性slgA分泌增加，在恢復期病人表現得尤為明顯，提示slgA對防止內毒素向機體內轉移具有保護性作用。

另外，有研究提示NO在腸黏膜局部形成的氧化屏障具有防止內毒素移位的作用。生理條件下，iNOS僅在呼吸上皮，妊娠子宮及回腸黏膜等少數部位表達。但在內毒素的誘導下，正常的結腸上皮細胞也表達 iNoS并催化合成NO，在局部形成氧化屏障，從而防止結腸細菌移位，因此有效地防止細菌的移位，也間接防止了內毒素的移位。